굴절률에 따른 transmission

안녕하세요. FDTD solution 을 사용하고 있습니다. 굴절률이 1.4인 pdms 에 굴절률이 1인 aerogel을 섞어 가시광에 노출했을 때의 refraction과 transmission 을 알고 싶습니다.
결과에서 transmission 값이 음수로 나와 다시 역으로 취해 구하고자하는 비슷한 값이 나왔으나, 그래프의 모양이 좀 많이 다릅니다. 혹시 왜그런지 알 수 있을까요?

시뮬레이션의 결과가 예상하는 것과 다르게 나와서 그 원인이 무엇인지 알고자 하는 것 같습니다. 시뮬레이션의 결과는 시뮬레이션 상의 설정에 의해 좌우됩니다. 따라서, 시뮬레이션 상의 수많은 설정이 구체적으로 어떤지를 알지 못한상태에서 사용한 물질의 굴절률값만을 가지고서, 시뮬레이션에 무슨 문제점이 있는 지 알수는 없습니다. 그리고, 예상하는 어떤 결과가 있다면 그것은 무엇에 근거한 것인지, 이론적인 배경이 있는 것이라면 그에 관한 정보도 공유를 해 주어야 제대로된 비교를 할 수 있을 것입니다.
질문과 관련한 구체적인 정보를 제공해 주시면, 문제점을 파악하고 해결하는 과정이 빨라질 수 있습니다.