各位老师好，

我之前在网站上问了一个问题，可是好几天过去了，并没有回复，不知道是不是工程师太忙了，所以在这边我用中文再询问一下。原问题的链接如下：

我的问题如下：
为了测试我们学校Linux集群上面的DEVICE CHARGE的测试性能，我找到了下面的几个网站作为参考：

我创建了两个同样的文件，分别在我自己的电脑以及学校的集群上面运行，但是结果截然不同。我自己电脑上面的结果看着是正确的，集群运行的结果，静电场分布十分混乱，明显是错误的电场分布，如下图所示：

下面为两个运行好的文件链接：

我在集群上面使用的运行脚本为： “mpirun /appl/FDTD/2020a-r3/bin/device-engine-mpich2nem -t 1 APD_3.ldev”。 在此之前，我利用脚本成功运行了FDTD仿真，脚本如下： “mpirun /appl/FDTD/8.20.1661/bin/fdtd-engine-ompi-lcl -t 1 gr1_V7.fsp”。我查阅了网站，好像是因为FDTD支持更多的MPI类型。

所以，我想知道如何处理此类问题呢？怎样才能在集群上面得到正确的结果？

PS：以下为我仿真的结果及部分参数。整个的设计是基于横向SACM的Ge-Si APD，结构参考这篇文章：
4459305.pdf (419.1 KB)

掺杂浓度选择如下：
p++: 1*e20 cm-3

p+: 5*e17 cm-3

p: 5*e17 cm-3

n+: 2*e17 cm-3

n++: 1*e20 cm-3

i-Si: 1*e15 cm-3

期待你的回复。
祝好！

你如果发在英语那边,一般来说就不能再发中文了,这次算例外,否则浪费资源.

你创建了两个文件?你应该用同一个文件在两台机器上分别跑才能说明问题.
另外,你设置的Dopping似乎与上图不完全一致,掺杂有叠加作用.

FDTD支持MPI, CHARGE,DGTD, 和FEEM 不需要另行设置就会自动应用系统的资源.

我测试了你的Cluster文件,的确与你源文件的结果不同.请提供你的Cluster的详细信息以及一些设置.

我另外在Linux系统测试同一个文件,结果也正确.

因此请来信告知你是怎么运行的(命令)和CLuster操作系统版本以及一些你的设置.

还有一个建议: 将PC的那个文件在Cluster上再测试一下.

老师：
你好！
我联系学校这边计算中心的工作人员，确认了是提交工作的脚本语言中出现了问题，mpirun只支持openmpi的文件，目前他们正在帮我调试此类文件该如何运行。

好的谢谢告知，等候进一步测试结果。不过，既然原来的脚本能够运行，难道它会把软件错误计算，有点不可思议。

老师：
你好！
继上次问题，这次我将在我电脑上运行成功的文件复制了一份，准备在集群上面运行。
经过计算中心的工作人员调试，目前可以利用脚本将文件提交到集群上。但是，总是得不到结果。返还的错误如下图所示：

图片1596×794 182 KB

图片1168×411 55.1 KB

我提交文件的脚本如下：

图片1247×105 4.75 KB

如果需要提供其他信息，请联系我。

DEVICE支持并行计算, 但是与FDTD不同，用户一般不需要设置，而是软件自行调配。
根据你上传的信息，似乎有些问题

image826×49 19.7 KB

image942×114 22.3 KB

2： 请将License.ini 文件发来我们看看。

据说，计算网格时不需要并行计算，所以即使前面有问题，也可以生成网格。

你测试看看。

老师：
你好！

我按照建议，无论是将-t 1改成-n 1，还是完全去掉，最后都会显示与之前相同的错误，找不到仿真区间。如下图所示：

图片1265×392 49.2 KB

图片1599×501 122 KB

下面为我们的License.ini文件，请查收。

祝好！

老师：
你好！

我根据下面的网页把提交工作的脚本从
“/appl/FDTD/2020a-r3/mpich2/nemesis/bin/mpiexec.hydra /appl/FDTD/2020a-r3/bin/device-engine-mpich2nem -t 1 PIN_junction.ldev”
改成
“/appl/FDTD/2020a-r3/bin/device-engine-mpich2nem PIN_junction.ldev”
可以得到正确的仿真的结果，所以这部分算是没有问题了。

下面我对APD的文件进行仿真。在非雪崩电压下的电学性能也可以准确仿真，但是当我对偏压进行扫描时，出现了新的错误，集群与DEVICE返回的文件分别如下图所示：

图片1496×239 22.5 KB

图片1290×510 52.3 KB

仿真未完成便自动退出。

此处，我想了解的是，在对电压进行扫描时，会出现雪崩状态并导致整个结果发散，正常情况下，我们可以手动保存退出。但是在集群上面，这个要怎么操作呢？这样的错误是不是因为这个原因造成的呢？

祝好！

谢谢告知！

根据你的Log文件显示，连第一个电压点都没有，所以建议你先不要扫描，而是设置为0偏压，看看能否运行。能运行后，电压值不要太大，先用小步长测试。

再有问题请另外发新帖。

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